為了貫徹十七大和全國科學技術大會精神，深入實踐科學發展觀，認真實施《國家中長期科學與技術發展規劃綱要》，進一步做好國家科學技術獎勵工作，保證國家科學技術獎的評審質量，更好地發揮國家科技獎勵的激勵和導向作用，科學技術部于2008年12月23日以科學技術部令第13號發布了《關于修改<國家科學技術獎勵條例實施細則>的決定》，對1999年12月24日公布、2004年12月27日修改的《國家科學技術獎勵條例實施細則》（科學技術部令第1號、第9號）進行了再次修改。
　　本次《國家科學技術獎勵條例實施細則》的修訂，旨在現有的《國家科學技術獎勵條例》所規定的國家科技獎勵制度框架體系下，從操作層面通過完善國家科技獎勵的內涵，加強對企業技術創新的獎勵，促進技術創新體系的建立和完善，引導創新要素向企業積聚；通過完善國家科技獎勵的條件標準，適當延緩成果完成后申報國家科技獎勵的時限，防止學術浮躁和急功近利的現象，倡導良好的學術風氣；通過完善國家科技獎勵推薦評審程序，提高評審工作的規范性、科學性和公開度，保證國家科技獎勵的公正性和權威性；通過完善國家科技獎勵監督機制和處罰機制，提高報獎者、推薦者、評審者及評審組織者的自律意識，控制管理工作的責任風險。
　　新修訂的《國家科學技術獎勵條例實施細則》于2009年2月1日起施行。